В 1919 году перед баллотировкой на пост директора Пулковской обсерватории в Академии наук, Аристарх Аполлонович снял свою кандидатуру и вернулся к своим любимым занятиям в лаборатории и на инструментах.
С 1990-х стал самым известным публичным атеистом и борцом со всеобщей клерикализацией, много выступал в СМИ против введения в школах «основ православной культуры».
